上海2022年4月13日 /美通社/ -- 人工智能(AI)、生物計(jì)算技術(shù)正賦能生命科學(xué)領(lǐng)域的研究,加速新藥研發(fā)的進(jìn)程。mRNA平臺(tái)技術(shù)在新冠疫苗的研發(fā)中脫穎而出,兩款新冠mRNA疫苗的上市也預(yù)示著這項(xiàng)前沿技術(shù)將對(duì)生物醫(yī)藥行業(yè)產(chǎn)生顛覆性影響。隨著人工智能技術(shù)與生物、醫(yī)藥等行業(yè)深度融合,mRNA技術(shù)在AI賦能下將迎來更加蓬勃的發(fā)展。
此前,百度研究院與斯微(上海)生物科技股份有限責(zé)任公司(以下簡(jiǎn)稱斯微生物)就新冠mRNA疫苗的開發(fā)展開了AI序列優(yōu)化算法的合作,開發(fā)了專門用于設(shè)計(jì)優(yōu)化mRNA序列的高效算法。該算法將自然語言處理領(lǐng)域中的"word lattice parsing"概念拓展到計(jì)算生物領(lǐng)域,能夠迅速設(shè)計(jì)出更穩(wěn)定更有效的新冠疫苗序列。
斯微生物完成了這種高效算法在新冠病毒mRNA疫苗分子設(shè)計(jì)上的生物學(xué)驗(yàn)證。結(jié)果顯示,在穩(wěn)定性、蛋白質(zhì)表達(dá)水平以及免疫原性等多個(gè)衡量疫苗的重要指標(biāo)上,通過這種算法設(shè)計(jì)的新冠疫苗序列優(yōu)于傳統(tǒng)方法設(shè)計(jì)的基準(zhǔn)序列;疫苗序列中和抗體滴度(疫苗最重要的指標(biāo)之一)是傳統(tǒng)基準(zhǔn)序列的20倍。除了新冠mRNA疫苗之外,該算法適用于包括傳染病、腫瘤以及罕見病在內(nèi)的各種mRNA疫苗或藥物序列的優(yōu)化設(shè)計(jì)。
日前,斯微生物與百度研究院再度攜手,雙方將在現(xiàn)有算法基礎(chǔ)上進(jìn)一步提升,除了擴(kuò)大線性mRNA算法優(yōu)化研究,雙方將嘗試開展環(huán)狀RNA等序列設(shè)計(jì)迭代技術(shù)的開發(fā),通過提升mRNA的穩(wěn)定性和翻譯效率來提高抗原蛋白的表達(dá)量及持續(xù)時(shí)間,有望將mRNA的優(yōu)勢(shì)更加充分的體現(xiàn),即提高效率,提升安全性,降低生產(chǎn)成本。
斯微生物創(chuàng)始人兼CEO李航文博士表示:
將AI技術(shù)應(yīng)用于生物制藥領(lǐng)域有利于打造交叉學(xué)科的藥物研發(fā)平臺(tái),有利于源頭創(chuàng)新。以AI進(jìn)行mRNA序列優(yōu)化能夠幫助mRNA更穩(wěn)定地表達(dá)出更多的蛋白。針對(duì)新冠病毒mRNA疫苗,相關(guān)算法10分鐘就設(shè)計(jì)出即穩(wěn)定和蛋白質(zhì)表達(dá)水平又高的疫苗分子,從而有效解決了mRNA疫苗研發(fā)中穩(wěn)定性這一難題,加快疫苗研發(fā)速度。我們與百度AI算法的聯(lián)合也將為我們?cè)谘泄芫€和RNA平臺(tái)帶來更大的提升,有望推出更多best-in-class的產(chǎn)品。
此次斯微生物攜手百度研究院把研究領(lǐng)域拓展到環(huán)狀RNA,將在增加mRNA的穩(wěn)定性和翻譯效率的同時(shí),增加藥物和疫苗的安全性。環(huán)狀mRNA是RNA研究最熱、最前沿的領(lǐng)域。雙方的合作開辟了新領(lǐng)域,是創(chuàng)新的嘗試。他認(rèn)為,相比線性mRNA,環(huán)狀mRNA更穩(wěn)定,在體內(nèi)持續(xù)作用時(shí)間大大加長,同時(shí)以環(huán)狀mRNA技術(shù)研發(fā)的藥物性能將更為優(yōu)越,用藥周期將被延長,有利于提升患者接受規(guī)范治療的依從性和方便性,未來應(yīng)用前景廣闊。
美國羅切斯特大學(xué)David Mathews教授評(píng)價(jià),相關(guān)算法設(shè)計(jì)了一組結(jié)構(gòu)更穩(wěn)定的序列,并使用優(yōu)化的密碼子。此算法高效的運(yùn)行速度是優(yōu)化序列設(shè)計(jì)的關(guān)鍵,這些序列可以通過實(shí)驗(yàn)檢驗(yàn)它們作為疫苗和藥物的效果。
mRNA疫苗的研發(fā)和生產(chǎn)是涉及到多項(xiàng)關(guān)鍵卡脖子技術(shù),斯微在每個(gè)技術(shù)平臺(tái)上都進(jìn)行自研或與國內(nèi)外頂尖機(jī)構(gòu)進(jìn)行合作。此次與百度的合作,具有引領(lǐng)國內(nèi)mRNA技術(shù)趕超世界水平的重要戰(zhàn)略意義。作為頭部mRNA疫苗及藥物研發(fā)企業(yè),兩家的強(qiáng)強(qiáng)合作能夠帶動(dòng)mRNA的研發(fā)與整體產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。