北京2019年7月15日 /美通社/ -- 近期,上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院(以下簡(jiǎn)稱“瑞金醫(yī)院”)與中科曙光達(dá)成合作,未來(lái)將建設(shè)一套符合國(guó)際標(biāo)準(zhǔn)、具備技術(shù)先進(jìn)性的“臨床資源深度分析和挖掘測(cè)序模塊計(jì)算平臺(tái)”(以下簡(jiǎn)稱“計(jì)算平臺(tái)”),通過(guò)提升醫(yī)療數(shù)據(jù)檢索、統(tǒng)計(jì)分析、圖形化呈現(xiàn)在內(nèi)的大規(guī)模數(shù)據(jù)挖掘能力,支持“轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)”的醫(yī)療、科研人員進(jìn)行總結(jié)和探索性的科研工作,讓寫在紙上的論文盡快變成用于臨床的新治療方法,聯(lián)手攻關(guān)危害人類健康的重大疾病。
IT與生物信息融合,解碼“生命信息”
在大數(shù)據(jù)、人工智能和高性能計(jì)算逐漸融合的趨勢(shì)下,設(shè)計(jì)與實(shí)現(xiàn)高性能的數(shù)據(jù)解讀學(xué)習(xí)模型、算法與軟件,是逾越生命信息學(xué)“數(shù)據(jù)鴻溝”的主要手段。
本次“臨床資源深度分析和挖掘測(cè)序模塊計(jì)算平臺(tái)”的建設(shè)將以患者生理生化指標(biāo),器官影像檢查、家族遺傳背景等多維度的數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),結(jié)合基因組測(cè)序、蛋白質(zhì)組學(xué)和代謝組學(xué)等各種先進(jìn)組學(xué)檢測(cè)等技術(shù),通過(guò)生物信息學(xué)手段進(jìn)行綜合數(shù)據(jù)分析和挖掘,提供與疾病診斷和治療相關(guān)的遺傳和臨床信息。形成特征數(shù)據(jù)后,再通過(guò)機(jī)器深度學(xué)習(xí)和人工智能等方法,實(shí)現(xiàn)真正意義上的精準(zhǔn)分析、輔助診斷和個(gè)性化醫(yī)療。
海量生物數(shù)據(jù)解讀,逾越“數(shù)據(jù)鴻溝”
基因組測(cè)序、蛋白質(zhì)組學(xué)、代謝組學(xué)等先進(jìn)組學(xué)檢測(cè)等技術(shù)在生命科學(xué)研究和人類健康領(lǐng)域的應(yīng)用是將生物信息轉(zhuǎn)化為數(shù)字信息,這些數(shù)據(jù)來(lái)自于大量的生物樣本、科研中間數(shù)據(jù)和實(shí)驗(yàn)結(jié)果,這些數(shù)字信息如同金礦一樣,等待被挖掘出不可估量的價(jià)值。
中科曙光憑借多年在生物基因領(lǐng)域積累的經(jīng)驗(yàn),打造生物基因行業(yè)云存儲(chǔ)解決方案。通過(guò)Scale-Out橫向擴(kuò)展、IB+RDMA高速互聯(lián)、內(nèi)核態(tài)POSIX協(xié)議、智能SSD Cache及小文件聚合等技術(shù),消除傳統(tǒng)的Scale-up縱向擴(kuò)展存儲(chǔ)架構(gòu)的性能局限性,解決生物基因應(yīng)用中對(duì)海量大文件存儲(chǔ)場(chǎng)景高聚合帶寬、小文件存儲(chǔ)場(chǎng)景高IOPS的存儲(chǔ)需求。
其次,基因研究產(chǎn)生的數(shù)據(jù)正以每12-18個(gè)月10倍的速度快速增長(zhǎng),曙光ParaStor分布式存儲(chǔ)系統(tǒng)可通過(guò)性能與容量的線性增長(zhǎng),滿足存儲(chǔ)系統(tǒng)對(duì)數(shù)據(jù)處理能力和擴(kuò)展性的要求,并通過(guò)多種技術(shù)手段,從物理底層到邏輯層全方位保證存儲(chǔ)系統(tǒng)高可靠性和高可用性,滿足前端多種基因測(cè)序軟件、多種業(yè)務(wù)應(yīng)用的存儲(chǔ)對(duì)接需求。
未來(lái),曙光生物基因行業(yè)云存儲(chǔ)解決方案將廣泛運(yùn)用于生命科學(xué)領(lǐng)域,為廣大客戶的業(yè)務(wù)提供有效的性能保障和技術(shù)支持。